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                bioRxiv:截至目前,新冠病毒的突变似乎并没有增加其传播力
                2020/05/27
                近日,来自英国破伦敦大学的研究人员对全球患看了眼唐韋者感染的SARS-CoV-2中发生的突变是否会改变病毒的传播性开展了研究,结果没有发现任何与病毒传播性增加有关的复发突变。

                引但卻也讓他們失去了戰斗力起新冠肺炎(COVID-19)的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是一种正义单链RNA病毒。在近6个月的全球传▅播中,其逐渐积累了许多突变,导致基因组呈现多样性。而这些突变可能会影响病毒的传播性能及毒力,或产生感染人类宿主的新位点。世界各地的研究团队都在持续监测SARS-CoV-2的基因组多样性,特别是新兴突变的分布和特征。


                冠状病毒突变主要通过三个过程实现:1)病毒复制过程中的复制错误产生突变,而SARS-CoV-2的校对机制会减少这种突变的产生一切事物;2)由于重组或重配而产生的基因组变异;3)由宿主RNA编辑系统诱导产生的突变,这是宿主自身免疫的一部分。在自然选择下,病毒发展中反复独立出现的突变则是可能具有威胁的重点关注对象。

                近日,来自英国伦敦大学的研究人员对全球患者感染的SARS-CoV-2中发生的突变是否会改变病毒的传播性开展了研究,结果没有发现任何与病毒传播性增加有关的复发突变。相反,复发性卐突变似乎主要是由宿主通过RNA编辑机制产生的免疫诱导的,并且可能对病毒有微弱的∑ 危害性。相关研究成果于当地时间5月21日发表在预印本杂志《bioRxiv》上。


                https://doi.org/10.1101/2020.05.21.108506

                具体来说,研究人员对来自75个国家的15691个SARS-CoV-2的基因组进行最大似然系统进化树分析,与参考基因组Wuhan-Hu-1相比,所有盯著鶴王株系发生的SNP均小于29个,计ζ 算其每年每个位点发生突变的速率约为9.7 x 10-4,该速率显著低于其他没有病毒校对机制的正义单链RNA病毒。这表明,目前SARS-CoV-2群体的遗传多样性仍然为中等∴,且所有SARS-CoV-2株系均为同一个克隆谱系。


                全球横跨多个国便加速趕路家的15,691个SARS-CoV-2的基因组多样性

                在基因组序列比对分析中,研究人员珠兒和楊空行成三角之狀朝攻擊共检测到6822个突变,经过※滤鉴定,273个为复突兀发突变。其中,碱基C突变为U的比▆例非常高,且在非同质和同质位点均可观察到这种模式,除此之外,涉及胞嘧啶的突变几乎全是C/U突变。研究人员还观察到在已知的APOBEC靶点位置含有一个可变碱基的富集,表瓶頸瞬間打破明这些突变的产生可能与宿主RNA编辑系统诱导相关。

                为了测试复发突变与病毒传播性间的关联,研究人员开发了一种新的系统发育指数,即同型后代比∩率(RoHO),以量化由获得特定突变又趁勢反擊了一些人的任何祖先病毒体产生的后代子代的比例。比较所有进化枝发现,没有一种复发性突变与病毒传播的增加显著相关,且有3个复发突变与病毒传播减少显著相关。有趣的是,log(RoHO)指数向负值的分布呈强█趋势,这表明大多数同质异型突变都是弱有害的。


                同型后代比率那就沒有活著(RoHO)评分指标背后原理的示意图


                全基因组同型哼后代比率(RoHO)得分

                总而言之,研究人员在迄今为止的全球范围的SARS-CoV-2株系中,没有检测到与病毒传播增加有关的任何复发突变。相反,有些复发突变呈现为中性或弱毒性的趋势,这显然会减弱SARS-CoV-2的传播。

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